設問2(1)について、「ファイル転送サーバーから研究開発PCへの通信はFW2で禁止されているから」が答えですが、一つ確認したことがあります。
FW2はステートフルパケットインスペクション型であるため、許可する通信がなければ、その後の通信であるファイル転送サーバから研究開発PCができないから、こういった答えになっているのでしょうか？

説明が下手ですが、解答していただけると幸いです。

つい最近、類似の質問が以下のスレッドありました。
[1166] 平成30年午後Ⅰ問3 設問2 について
https://www.sc-siken.com/bbs/1166.html

疑問点はこのスレッドの回答で解決するのではと思います。